29. SĒJUMS, 4. NUMURS • 2025. GADA DECEMBRIS.
2025 kustību traucējumi Gada apskata raksts
Neirodeģeneratīvo slimību izpēte, izmantojot ilgstošas sekvencēšanas un optiskās genoma kartēšanas tehnoloģijas
Mēs esam priecīgi, ka mums ir piešķirta balva “2025. gada apskata raksts”. kustību traucējumi žurnāls. Pēc iesniegšanas kustību traucējumi Rakstā, kurā aprakstīti divi brāļi un māsas ar fenotipu, kas ir saderīgs ar ar PRKN saistītu Parkinsona slimību (PS), kas atrisināta ar ilgstošas lasīšanas sekvencēšanu (LRS), galvenais redaktors laipni aicināja mūs uzrakstīt apskatu, kurā uzmanība pievērsta jaunajām tehnoloģijām auditorijai, kas nav ģenētiķi.
Mēs uzskatījām, ka šis pārskats tika publicēts īstajā laikā divu iemeslu dēļ. Pirmkārt, arvien vairāk cilvēku izmantoja LRS neirodeģeneratīvo slimību kontekstā, un arvien vairāk pierādījumu literatūrā apstiprināja tā spēju atrisināt gadījumus, kas nav izskaidroti ar visa eksoma vai visa genoma īslasīšanas sekvencēšanu. Otrkārt, jaunāko pārskatu 2021. gadā publicēja Su et al. žurnālā Neurology, tāpēc šķita nepieciešams atjauninājums. Mēs ar prieku pieņēmām rakstu un centāmies piedāvāt plašu skatījumu uz jaunākajiem sasniegumiem gan LRS, gan optiskās genoma kartēšanas (OGM) jomā, kā arī to ierobežojumiem, izaicinājumiem un iespējām nākotnē.
Pastāv trīs galvenie ģenētisko variāciju veidi, kas ietekmē cilvēka īpašības: mazi varianti (varianti, kas ietver mazāk nekā 50 bāzes pārus, ko sauc arī par viena nukleotīda variantiem un iestarpinājumiem/delēcijām), īsi tandēma atkārtojumi (pazīstami arī kā atkārtojumu ekspansijas RE) un strukturāli varianti (SV, delēcijas, iestarpinājumi, dublēšanās, inversijas, translokācijas). Daudzām, iespējams, monogēnām slimībām joprojām trūkst precīzas molekulārās diagnostikas, galvenokārt tāpēc, ka tradicionālās sekvencēšanas metodes nav efektīvas SV un RE noteikšanā, kas abi ir daudzu neiroģenētisku slimību cēlonis. Tāpēc vairākas iniciatīvas ir vērstas uz LRS un/vai OGM izmantošanu, lai atšifrētu neirodeģeneratīvo slimību ģenētisko pamatu. Pārskatā mēs sniedzām vairākus visaptverošus piemērus, lai lasītājam sniegtu izpratni par LRS un OGM sasniegumiem. Mēs apspriežam, kā LRS ļāva mums atklāt variantus, ko īslasīšanas sekvencēšana neizpauž zināmās neirodeģeneratīvās slimībās (piemēram, PRKN, SPG4), un atklāt jaunus cēloniskos gēnus (piemēram, neironu intranukleārā iekļaušanas slimība un NOTCH2NLC 5'UTR ekspansija, spinocerebelārā ataksija 4. tips un ZFHX3). Mēs arī ilustrējam LRS spēju raksturot atkārtojumu lielumu un motīvu, kas ietekmē saslimšanas vecumu, penetranci, iedzimtību un klīniskos fenotipus (CANVAS un RFC1, FXTAS un FMR1, SCA27B un FGF14). Mēs arī aprakstām iespēju fāzēt variantus, izmantojot LRS, un atšķirt variantus gēnos no tiem, kas atrodas to pseidogēnā (GBA1, SORD2), kā arī iespēju identificēt jaunus transkriptus. Mēs arī uzsveram optiskās genoma kartēšanas plusus un mīnusus SV un RE identificēšanā. Lai gan šīs tehnoloģijas pagaidām galvenokārt tiek izmantotas pētniecības vidē, mēs paredzam plašāku ieviešanu klīniskajās laboratorijās nākotnē. Mēs ceram, ka šis pārskats palīdzēs profesionāļiem izprast to lietderību un ierobežojumus, kā arī gudri izmantot tās gan diagnostikas, gan pētniecības kontekstā!
Klausieties podkāsta interviju par šo rakstu:
Klausieties tagad
Vairāk Virzoties tālāk: